许家磊¹ , 李强^1,2 , 后猛^1,2 , 刘亚菊^1,2 , 王欣^1,2 , 唐维^1,2 , 闫会^1,2 , 张允刚^1,2 , 马代夫^1,2

1 中国农业科学院甘薯研究所, 甘薯遗传改良重点开放实验室/农业部甘薯生物学与遗传改良重点实验室, 徐州, 22113;
2 江苏徐州甘薯研究中心, 江苏徐淮地区徐州农业科学研究所, 徐州, 221131
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2015 年, 第 13 卷, 第 26 篇   doi: 10.13271/j.mpb.013.000891
收稿日期: 2014年10月30日    接受日期: 2014年12月13日    发表日期: 2015年01月05日

单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP)广泛存在于甘薯基因组中，可用于甘薯遗传图谱的构建、关联分析和分子标记辅助选择等重要研究。本研究采用两种特异性扩增的方法：等位基因特异性PCR (AS-PCR)和四引物扩增薯受阻突变体系PCR (Tetra-primer ARMS-PCR)，以及酶切扩增多态性序列(CAPS)酶切的方法，对甘薯徐781和徐薯18之间的2个SNP位点T2-32906 (C/G)和T3-30695 (G/A)进行检测，并通过比较3种检测方法的检测效果，找出快速高效的甘薯SNP分子标记检测方法。琼脂糖凝胶电泳结果显示：AS-PCR的检测结果在2个样本之间出现假阳性而没有明显的差异条带，Tetra-primer ARMS-PCR和CAPS两种方法的检测结果在2个样本间呈现出明显的差异条带，并且能够根据条带数目区分等位基因是否纯合。三种方法的检测结果表明：相对于其他两种检测方法，Tetra-primer ARMS-PCR呈现出更理想的检测效果。另外通过成本比较，Tetra-primer ARMS-PCR成本明显低于CAPS。因此，Tetra-primer ARMS-PCR是一种可用于甘SNP位点快速、高效且费用低廉的分子检测方法。

甘薯；SNP标记；检测方法；高效